超净工作台的工作原理是，空气经顶后部的初效空气过滤器和低噪音离心式通风机压入静压箱，经高效空气过滤器在上侧部均匀吹出，形成高度洁净度的水平垂直空气幕，去除工作区域内的原自然空气，开机后五分钟即达到理想的高洁净度空间。
按照操作方式分类，超净工作台可以分为单人单面、单人双面、双人单面 、双人双面、三人单面等5种超净工作台；按其气流方向，可分为水平单向流超净工作台、垂直单向流超净工作台和非单向流超净工作台。其中，水平单向流超净工作台主要运用在制药等行业，水平单向流超净工作台则主要运用于实验室、生物制药等行业。
超净工作台的风机和过滤器代表了产品的技术水平。目前，我国的超净工作台与此前相比，虽然已经有了很大的进度，但与国外设备相比还存在一定的差距。
据了解，国外的风机噪音小，振动低，使得操作人员可以在一个安静的环境下进行实验。而我国的风机在噪音消减方面还待改进。
而过滤器直接影响超净工作台的洁净度及使用寿命，所以质量好的过滤器在成本上会较低档次的过滤器高很多，这也是进口超净工作台价格昂贵的原因。
据了解，国外的超净工作台采用超低穿透率空气过滤器，使得滤料结构更紧凑、过滤效率更高，过滤面积更大，容尘能力也更强，大大提升制药行业或实验室工作区的洁净度。
业内人士指出，过滤器的使用寿命长短除了与质量相关联，还与空气的洁净程度以及仪器的使用频率有关。
据了解，在温带地区，超净工作台可在一般实验室使用。而在热带或亚热带地区，由于大气中含有高量的花粉或多粉尘，超净工作台只适合放置在较好的有双道门的室内使用。并且需要尽量不让超净台的进风罩对着开敞的门或窗，以免影响空气过滤器的使用寿命。
另外，随着用户要求越来越高，一些制药企业除了对技术等方面有要求以外，对设备的外观也更加重视。因此，在设备的制造材料方面，可以看到，国外超净工作台的外观制作较为精致新颖，材料使用的是不锈钢材质，所以在外壳上也会产生较高的成本，
随着一致性评价的推进，药品采购的试点，以及审批审评速度的加快，我国仿制药有望实现进口替代，医药行业迎来良好的发展态势。业内预计，2019年我国药品零售额将进一步增长，生物制药进入黄金时代。
在此背景下，医药行业对于超净工作台的需求以及要求势必也将不断提升，我国超净工作台研制厂家需打破依赖进口设备的局面，从风机、过滤器的性能、效率、寿命等方面加以研究与创新，增强设备美观度，不断满足国内药企的需求，才能在市场上拥有一定的话语权。