针对目前超纯水设备的使用情况，有厂家提醒，再先进的设备也需要培养正确的操作习惯。“为让超纯水设备能够正产工作，有些事项是不能忽略的。”
比如，超纯水设备的过滤器要定期反洗，反洗时进行压缩空气气体摩擦，反洗合格后需静置10分钟左右再正洗。正洗出水合格后方可投入使用。
需要提醒的是，不要将空气带入反渗透，在不影响sdi值的情况下，尽可能延长机械过滤器的运行时间，这样既减少了切换过滤器对出水水质的冲击，又节约了大量反洗用水。
要定期检查、及时更换过滤器滤芯，防止滤芯因安装或质量问题发生泄露，引起的反渗透膜的颗粒污染，当过滤器进口压差大于0.15mpa时，应更换滤芯。
通常情况下，一般应每月检查一次，2~3个月更换一次滤芯，运行时还应经常检查精密过滤器内是否有气体，不能让空气带入反渗透膜。此外，还要对备用或长期停运的过滤器，采取加甲醛保护的方法，防止细菌大量繁殖。
用户还要定期对水质进行化验分析，要根据实际情况及时调整絮凝剂、杀菌剂、还原剂及阻垢剂的加药量，防止絮凝剂穿透过滤器与阻垢剂反应，影响足够效果，或污染反渗透膜。
停用的超纯水机应定期低压冲洗，尤其是夏天，应做到每班冲洗一次。如果停运时间大于7天，用户需要用0.5%～1%的亚硫酸氢钠或0.5%～1%的甲醛溶液对反渗透膜进行保护，还要及时检测保护液的ph值和浓度。
在操作过程中，如果发现与初始投用状态相比，标准化的反渗透装置产水量下降10%，或在特定条件下产水含盐量明显上升，或压差增加了15%时，用户应对反渗透膜进行及时清洗。
当然，还要防止杀菌剂用量不足而使反渗透膜受细菌污染，或因杀菌剂过量而使膜被氧化；防止阻垢剂含量不足使浓水结垢而导致膜化学污染。
在日常使用超纯水设备的过程中，有客户会反映一个问题，就是超纯水设备中的反渗透膜很容易出现水垢。超纯水设备专家分析，出现结水垢的现象主要是超纯水设备在长时间使用的过程汇总，通过反渗透膜两侧的压力差作为动力，进行水交换。
在水不断的交换同时，会导致大量的盐聚集，盐中含有大量的沉淀物质，时间长了就会发生结垢现象，结垢严重会影响纯净水的质量。因此，用户在日常使用过程中要及时预防结水垢的情况。
有技术人员表示，在使用超纯水设备的时候，要保持过滤器的过滤速度，并且保持匀速。因为，合理的过滤速度可以保证超纯水设备的净化效果。另外，在滤料的选择上，技术人员建议，要选择颗粒度大小基本一致的滤料，这样滤出来的水会更彻底。