《办法》是《中央生态环境保护督察工作规定》的配套制度，共5章25条，明确了专项督察对象和重点，规范了专项督察程序和权限，严格了专项督察纪律和要求。制定过程中，中央生态环境保护督察办公室梳理总结了近年来专项督察工作实践，将既符合专项督察特点、又行之有效的工作机制和具体做法予以制度化。
根据《办法》，专项督察工作坚持直奔问题、强化震慑，对习近平总书记作出重要指示批示的生态环境问题整改落实不力，党中央、国务院和中央生态环境保护督察工作领导小组交办事项落实不力，中央生态环境保护督察发现问题整改不力等情形，开展重点督察。督察工作流程包括督察准备、督察进驻、督察报告、督察反馈、移交移送、督察整改、立卷归档等环节。督察过程中，坚持优化方式方法，加强明查与暗访相结合，充分利用卫星遥感、无人机航拍、信息化等新技术、新方法。
下一步，中央生态环境保护督察办公室将持续深化专项督察实践，推进《办法》贯彻落实，推动中央生态环境保护督察向纵深发展。